1997年1月24日至5月5日,湄洲妈祖金身巡游台湾,在台湾35个妈祖庙宇驻跸,巡游102天,万人空巷,场面壮观。
2002年5月8日至12日,湄洲妈祖金身首次从海上直航巡安金门岛,创下了50多年来两岸交往史的“四个第一”:第一次以海上直航的方式出巡;第一次到金门接受信众朝拜;第一次启动湄洲岛三千吨客运码头;第一次实现湄洲岛、金门岛、乌丘岛之间客运码头的通航。